Stereochemistry and Configuration त्रिविम रसायन और विन्यास (Stereochemistry and Configuration)
- All naturally occurring α-amino acids except glycine contain at least one chiral center and exhibit optical activity.
- Almost all proteinogenic amino acids possess the L-configuration based on the Fischer projection correlation with L-glyceraldehyde.
- Amino acids exist predominantly as zwitterions (dipolar ions) in aqueous solutions across a specific pH range.
- Glycine is the only proteinogenic amino acid lacking optical isomerism due to a hydrogen atom serving as its R-group.
- ग्लाइसिन को छोड़कर सभी प्राकृतिक रूप से पाए जाने वाले α-अमीनो अम्लों में कम से कम एक कायरल केंद्र (chiral center) होता है और वे प्रकाशिक सक्रियता (optical activity) प्रदर्शित करते हैं।
- लगभग सभी प्रोटीनोजेनिक अमीनो अम्लों में L-ग्लिसराल्डिहाइड के साथ फिशर प्रक्षेपण (Fischer projection) सहसंबंध के आधार पर L-विन्यास होता है।
- अमीनो अम्ल जलीय विलयनों में एक विशिष्ट pH सीमा पर मुख्य रूप से ज़्विटर आयन (zwitterions/dipolar ions) के रूप में मौजूद होते हैं।
- ग्लाइसिन एकमात्र प्रोटीनोजेनिक अमीनो अम्ल है जिसमें R-समूह के रूप में हाइड्रोजन परमाणु होने के कारण प्रकाशिक समावयवता (optical isomerism) का अभाव होता है।
Acid-Base Properties and Isoelectric Point अम्ल-क्षार गुण और समविभव बिंदु (Acid-Base Properties and Isoelectric Point)
- In strongly acidic media, amino acids exist as cations and migrate toward the cathode during electrolysis.
- In strongly alkaline media, amino acids exist as anions and migrate toward the anode.
- The isoelectric point (pI) is the specific pH at which the net electrical charge of the amino acid is zero and migration in an electric field ceases.
- Amino acids with acidic side chains (e.g., aspartic acid) possess lower pI values, while basic side chains (e.g., lysine) yield higher pI values.
- अत्यधिक अम्लीय माध्यम में, अमीनो अम्ल धनायनों (cations) के रूप में मौजूद होते हैं और विद्युत अपघटन (electrolysis) के दौरान कैथोड की ओर गमन करते हैं।
- अत्यधिक क्षारीय माध्यम में, अमीनो अम्ल ऋणायनों (anions) के रूप में मौजूद होते हैं और एनोड की ओर गमन करते हैं।
- समविभव बिंदु (Isoelectric point - pI) वह विशिष्ट pH है जिस पर अमीनो अम्ल का कुल विद्युत आवेश शून्य होता है और विद्युत क्षेत्र में गमन रुक जाता है।
- अम्लीय पार्श्व श्रृंखलाओं (जैसे, एस्पार्टिक अम्ल) वाले अमीनो अम्लों का pI मान कम होता है, जबकि क्षारीय पार्श्व श्रृंखलाएं (जैसे, लाइसिन) उच्च pI मान प्रदान करती हैं।
Characteristic Chemical Reactions अभिलक्षणिक रासायनिक अभिक्रियाएं (Characteristic Chemical Reactions)
- Reaction with ninhydrin yields a characteristic purple-blue complex (Ruhemann's purple), utilized for quantitative and qualitative colorimetric detection.
- Treatment with nitrous acid (HNO2) converts the primary amino group to a hydroxyl group with the evolution of nitrogen gas (Van Slyke method).
- Esterification of the carboxyl group with alcohols in the presence of dry HCl gas produces amino acid esters.
- Peptide bond formation proceeds via condensation between the carboxyl group of one amino acid and the amino group of another with the elimination of water.
- निनहाइड्रिन (ninhydrin) के साथ अभिक्रिया एक विशिष्ट बैंगनी-नीला संकुल (Ruhemann's purple) प्रदान करती है, जिसका उपयोग मात्रात्मक और गुणात्मक वर्णमिति (colorimetric) पहचान के लिए किया जाता है।
- नाइट्रस अम्ल (HNO2) के साथ उपचार प्राथमिक अमीनो समूह को नाइट्रोजन गैस के उत्सर्जन के साथ हाइड्रॉक्सिल समूह में परिवर्तित कर देता है (वैन स्लाईक विधि)।
- शुष्क HCl गैस की उपस्थिति में अल्कोहल के साथ कार्बोक्सिल समूह का एस्टरीकरण (esterification) अमीनो अम्ल एस्टर उत्पन्न करता है।
- पेप्टाइड बंध (peptide bond) का निर्माण एक अमीनो अम्ल के कार्बोक्सिल समूह और दूसरे के अमीनो समूह के बीच जल के निष्कासन के साथ संघनन (condensation) द्वारा होता है।
Observation: Glycine — Glycine has two identical hydrogen atoms attached to the α-carbon, making it achiral. प्रेक्षण: ग्लाइसिन — ग्लाइसिन के α-कार्बन से दो समान हाइड्रोजन परमाणु जुड़े होते हैं, जिससे यह अकिरल (achiral) हो जाता है।
Observation: Proline — Proline contains a secondary cyclic imino group incorporated into a five-membered pyrrolidine ring. प्रेक्षण: प्रोलाइन — प्रोलाइन में पांच-सदस्यीय पाइरोलिडिन वलय में शामिल एक द्वितीयक चक्रीय इमिनो समूह होता है।
Observation: D-amino acids — Found occasionally in bacterial cell walls and peptide antibiotics, distinct from mammalian proteins. प्रेक्षण: D-अमीनो अम्ल — कभी-कभी जीवाणु कोशिका भित्तियों और पेप्टाइड एंटीबायोटिक दवाओं में पाए जाते हैं, जो स्तनधारी प्रोटीनों से भिन्न होते हैं।
Application: Average the two pKa values corresponding to the carboxyl and ammonium dissociations. अनुप्रयोग: कार्बोक्सिल और अमोनियम वियोजन के अनुरूप दो pKa मानों का औसत निकालें।
Application: Remember that secondary amino acids like proline yield a yellow color instead of Ruhemann's purple. अनुप्रयोग: याद रखें कि प्रोलाइन जैसे द्वितीयक अमीनो अम्ल रूहमान बैंगनी के बजाय पीला रंग देते हैं।
Application: Mnemonic for essential amino acids: Phe, Val, Thr, Trp, Ile, Met, His, Arg, Leu, Lys. अनुप्रयोग: आवश्यक अमीनो अम्लों के लिए स्मृति सहायक: Phe, Val, Thr, Trp, Ile, Met, His, Arg, Leu, Lys।
| Parameterपैरामीटर | Acidic Amino Acidsअम्लीय अमीनो अम्ल | Basic Amino Acidsक्षारीय अमीनो अम्ल | Neutral Amino Acidsउदासीन अमीनो अम्ल |
|---|---|---|---|
| Side Chain (R)पार्श्व श्रृंखला (R) | Contains extra −COOHअतिरिक्त -COOH युक्त | Contains extra −NH2 or basic heterocycleअतिरिक्त -NH2 या क्षारीय हेट्रोसायकल युक्त | Hydrocarbon or neutral polar groupहाइड्रोकार्बन या उदासीन ध्रुवीय समूह |
| Net Charge at pH 7pH 7 पर कुल आवेश | Negative (−1)ऋणात्मक (-1) | Positive (+1)धनात्मक (+1) | Zero (Zwitterionic)शून्य (ज़्विटर आयनिक) |
| Representative Exampleप्रतिनिधि उदाहरण | Aspartic Acidएस्पार्टिक अम्ल | Lysineलाइसिन | Alanineएलानीन |
- Glycine is optically inactive because the α-carbon is bonded to two identical hydrogen atoms.
- Proteins yield exclusively L-amino acids upon complete acid or enzymatic hydrolysis.
- The zwitterionic form gives amino acids high melting points and high water solubility due to strong electrostatic interactions.
- Ninhydrin test detects primary amines down to microgram quantities, producing a purple color.
- Sanger's reagent (1-fluoro-2,4-dinitrobenzene) is used for N-terminal amino acid analysis in peptides.
- Isoelectric precipitation is widely used for isolating and purifying specific amino acids and proteins.
- ग्लाइसिन प्रकाशिक रूप से निष्क्रिय है क्योंकि α-कार्बन दो समान हाइड्रोजन परमाणुओं से बंधा होता है।
- प्रोटीन पूर्ण अम्लीय या एंजाइमी जल-अपघटन पर विशेष रूप से L-अमीनो अम्ल देते हैं।
- ज़्विटर आयनिक रूप मजबूत इलेक्ट्रोस्टैटिक अंतःक्रियाओं के कारण अमीनो अम्लों को उच्च गलनांक और उच्च जल घुलनशीलता प्रदान करता है।
- निनहाइड्रिन परीक्षण माइक्रोग्राम मात्रा तक प्राथमिक एमाइन का पता लगाता है, जिससे बैंगनी रंग उत्पन्न होता है।
- सेंजर अभिकर्मक (1-fluoro-2,4-dinitrobenzene) का उपयोग पेप्टाइड्स में N-टर्मिनल अमीनो अम्ल विश्लेषण के लिए किया जाता है।
- समविभव अवक्षेपण (isoelectric precipitation) का उपयोग विशिष्ट अमीनो अम्लों और प्रोटीनों को अलग करने और शुद्ध करने के लिए व्यापक रूप से किया जाता है।
- Assuming all amino acids rotate plane-polarized light in the dextrorotatory direction.
- Confusing the D/L sugar/amino acid descriptor system with the optical rotation (+/-) or d/l configuration system.
- Forgetting that proline contains a secondary amine rather than a primary amine.
- Calculating the isoelectric point of acidic or basic amino acids using only pKa1 and pKa2.
- यह मान लेना कि सभी अमीनो अम्ल समतल-ध्रुवित प्रकाश को दक्षिणावर्त (dextrorotatory) दिशा में घुमाते हैं।
- D/L शर्करा/अमीनो अम्ल वर्णक प्रणाली को प्रकाशिक घूर्णन (+/-) या d/l विन्यास प्रणाली के साथ भ्रमित करना।
- यह भूल जाना कि प्रोलाइन में प्राथमिक एमाइन के बजाय द्वितीयक एमाइन होता है।
- केवल pKa1 और pKa2 का उपयोग करके अम्लीय या क्षारीय अमीनो अम्लों के समविभव बिंदु की गणना करना।